Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Casq1O09165 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Casq1O09165 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Casq1O09165 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Casq1O09165 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Casq1O09165 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Casq1O09165 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Casq1O09165 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Casq1O09165 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Casq1O09165 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Casq1O09165 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Casq1O09165 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Casq1O09165 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Casq1O09165 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Casq1O09165 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Casq1O09165 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Casq1O09165 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Casq1O09165 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Casq1O09165 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Casq1O09165 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Casq1O09165 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Casq1O09165 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Casq1O09165 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Casq1O09165 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Casq1O09165 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Casq1O09165 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Casq1O09165 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Casq1O09165 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Casq1O09165 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Casq1O09165 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Casq1O09165 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Casq1O09165 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Casq1O09165 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Casq1O09165 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Casq1O09165 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Casq1O09165 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Casq1O09165 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Casq1O09165 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Casq1O09165 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Casq1O09165 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Casq1O09165 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Casq1O09165 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Casq1O09165 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Casq1O09165 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Casq1O09165 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Casq1O09165 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Casq1O09165 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Casq1O09165 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Casq1O09165 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Casq1O09165 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Casq1O09165 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Casq1O09165 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Casq1O09165 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Casq1O09165 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Casq1O09165 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Casq1O09165 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Casq1O09165 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Casq1O09165 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Casq1O09165 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Casq1O09165 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Casq1O09165 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Casq1O09165 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Casq1O09165 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Casq1O09165 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Casq1O09165 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Casq1O09165 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Casq1O09165 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Casq1O09165 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Casq1O09165 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Casq1O09165 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Casq1O09165 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Casq1O09165 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Casq1O09165 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Casq1O09165 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Casq1O09165 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Casq1O09165 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Casq1O09165 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Casq1O09165 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Casq1O09165 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Casq1O09165 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Casq1O09165 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Casq1O09165 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Casq1O09165 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Casq1O09165 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Casq1O09165 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Casq1O09165 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Casq1O09165 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Casq1O09165 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Casq1O09165 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Casq1O09165 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Casq1O09165 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Casq1O09165 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Casq1O09165 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Casq1O09165 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Casq1O09165 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Casq1O09165 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Casq1O09165 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Casq1O09165 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Casq1O09165 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Casq1O09165 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms