Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MttpO08601 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MttpO08601 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MttpO08601 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MttpO08601 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MttpO08601 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MttpO08601 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MttpO08601 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MttpO08601 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MttpO08601 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MttpO08601 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MttpO08601 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MttpO08601 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MttpO08601 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MttpO08601 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MttpO08601 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MttpO08601 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MttpO08601 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MttpO08601 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MttpO08601 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MttpO08601 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MttpO08601 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MttpO08601 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MttpO08601 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MttpO08601 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MttpO08601 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MttpO08601 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MttpO08601 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MttpO08601 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MttpO08601 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MttpO08601 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MttpO08601 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MttpO08601 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MttpO08601 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MttpO08601 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MttpO08601 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MttpO08601 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MttpO08601 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MttpO08601 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MttpO08601 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MttpO08601 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MttpO08601 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MttpO08601 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MttpO08601 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MttpO08601 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MttpO08601 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MttpO08601 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MttpO08601 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MttpO08601 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MttpO08601 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MttpO08601 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MttpO08601 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MttpO08601 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MttpO08601 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MttpO08601 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MttpO08601 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MttpO08601 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MttpO08601 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MttpO08601 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MttpO08601 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MttpO08601 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MttpO08601 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MttpO08601 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MttpO08601 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MttpO08601 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MttpO08601 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MttpO08601 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MttpO08601 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MttpO08601 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MttpO08601 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MttpO08601 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MttpO08601 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MttpO08601 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MttpO08601 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MttpO08601 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MttpO08601 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MttpO08601 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MttpO08601 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MttpO08601 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MttpO08601 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MttpO08601 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MttpO08601 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MttpO08601 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MttpO08601 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MttpO08601 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MttpO08601 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MttpO08601 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MttpO08601 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MttpO08601 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MttpO08601 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MttpO08601 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MttpO08601 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MttpO08601 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MttpO08601 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MttpO08601 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MttpO08601 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MttpO08601 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MttpO08601 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MttpO08601 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MttpO08601 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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