Protein–RNA interactions for Protein: M0QWJ9

Tmem178b, Transmembrane protein 178B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem178bM0QWJ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem178bM0QWJ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem178bM0QWJ9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem178bM0QWJ9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem178bM0QWJ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem178bM0QWJ9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem178bM0QWJ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem178bM0QWJ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem178bM0QWJ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem178bM0QWJ9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem178bM0QWJ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem178bM0QWJ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem178bM0QWJ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem178bM0QWJ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem178bM0QWJ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem178bM0QWJ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms