Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3239L7N2D9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3239L7N2D9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3239L7N2D9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3239L7N2D9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3239L7N2D9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3239L7N2D9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3239L7N2D9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3239L7N2D9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3239L7N2D9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3239L7N2D9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3239L7N2D9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3239L7N2D9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3239L7N2D9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3239L7N2D9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3239L7N2D9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3239L7N2D9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3239L7N2D9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3239L7N2D9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3239L7N2D9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3239L7N2D9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3239L7N2D9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3239L7N2D9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3239L7N2D9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3239L7N2D9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3239L7N2D9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3239L7N2D9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3239L7N2D9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3239L7N2D9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3239L7N2D9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3239L7N2D9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3239L7N2D9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3239L7N2D9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3239L7N2D9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3239L7N2D9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3239L7N2D9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3239L7N2D9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3239L7N2D9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3239L7N2D9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3239L7N2D9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3239L7N2D9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3239L7N2D9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3239L7N2D9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3239L7N2D9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3239L7N2D9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3239L7N2D9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3239L7N2D9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm3239L7N2D9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3239L7N2D9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3239L7N2D9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3239L7N2D9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3239L7N2D9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3239L7N2D9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3239L7N2D9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3239L7N2D9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3239L7N2D9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3239L7N2D9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3239L7N2D9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3239L7N2D9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3239L7N2D9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3239L7N2D9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3239L7N2D9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3239L7N2D9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3239L7N2D9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3239L7N2D9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3239L7N2D9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3239L7N2D9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3239L7N2D9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3239L7N2D9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3239L7N2D9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3239L7N2D9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3239L7N2D9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3239L7N2D9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms