Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm5814J3QP80 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm5814J3QP80 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm5814J3QP80 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm5814J3QP80 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm5814J3QP80 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm5814J3QP80 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm5814J3QP80 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm5814J3QP80 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm5814J3QP80 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm5814J3QP80 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gm5814J3QP80 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm5814J3QP80 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm5814J3QP80 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm5814J3QP80 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm5814J3QP80 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm5814J3QP80 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm5814J3QP80 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm5814J3QP80 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm5814J3QP80 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm5814J3QP80 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm5814J3QP80 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm5814J3QP80 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm5814J3QP80 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm5814J3QP80 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm5814J3QP80 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm5814J3QP80 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm5814J3QP80 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Gm5814J3QP80 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm5814J3QP80 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm5814J3QP80 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm5814J3QP80 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm5814J3QP80 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm5814J3QP80 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm5814J3QP80 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm5814J3QP80 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm5814J3QP80 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm5814J3QP80 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm5814J3QP80 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gm5814J3QP80 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm5814J3QP80 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm5814J3QP80 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm5814J3QP80 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm5814J3QP80 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm5814J3QP80 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm5814J3QP80 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm5814J3QP80 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm5814J3QP80 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm5814J3QP80 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm5814J3QP80 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm5814J3QP80 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm5814J3QP80 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm5814J3QP80 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm5814J3QP80 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm5814J3QP80 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm5814J3QP80 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm5814J3QP80 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm5814J3QP80 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm5814J3QP80 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm5814J3QP80 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm5814J3QP80 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm5814J3QP80 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm5814J3QP80 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm5814J3QP80 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm5814J3QP80 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm5814J3QP80 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm5814J3QP80 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm5814J3QP80 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm5814J3QP80 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm5814J3QP80 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm5814J3QP80 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm5814J3QP80 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm5814J3QP80 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm5814J3QP80 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm5814J3QP80 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm5814J3QP80 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm5814J3QP80 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm5814J3QP80 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm5814J3QP80 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm5814J3QP80 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm5814J3QP80 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm5814J3QP80 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm5814J3QP80 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm5814J3QP80 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm5814J3QP80 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm5814J3QP80 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm5814J3QP80 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm5814J3QP80 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm5814J3QP80 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm5814J3QP80 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm5814J3QP80 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm5814J3QP80 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm5814J3QP80 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm5814J3QP80 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm5814J3QP80 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm5814J3QP80 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm5814J3QP80 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm5814J3QP80 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm5814J3QP80 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm5814J3QP80 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms