Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shisa8J3QNX5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shisa8J3QNX5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shisa8J3QNX5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Shisa8J3QNX5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shisa8J3QNX5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shisa8J3QNX5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shisa8J3QNX5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shisa8J3QNX5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shisa8J3QNX5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shisa8J3QNX5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shisa8J3QNX5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shisa8J3QNX5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shisa8J3QNX5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shisa8J3QNX5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shisa8J3QNX5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shisa8J3QNX5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shisa8J3QNX5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shisa8J3QNX5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shisa8J3QNX5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shisa8J3QNX5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shisa8J3QNX5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Shisa8J3QNX5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shisa8J3QNX5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shisa8J3QNX5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shisa8J3QNX5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shisa8J3QNX5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shisa8J3QNX5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shisa8J3QNX5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Shisa8J3QNX5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shisa8J3QNX5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shisa8J3QNX5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shisa8J3QNX5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shisa8J3QNX5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shisa8J3QNX5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shisa8J3QNX5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Shisa8J3QNX5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shisa8J3QNX5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shisa8J3QNX5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shisa8J3QNX5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shisa8J3QNX5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shisa8J3QNX5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shisa8J3QNX5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shisa8J3QNX5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shisa8J3QNX5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shisa8J3QNX5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shisa8J3QNX5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shisa8J3QNX5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shisa8J3QNX5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shisa8J3QNX5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shisa8J3QNX5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shisa8J3QNX5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shisa8J3QNX5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shisa8J3QNX5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shisa8J3QNX5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shisa8J3QNX5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shisa8J3QNX5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms