Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
1700014D04RikJ3QMS2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700014D04RikJ3QMS2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700014D04RikJ3QMS2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
1700014D04RikJ3QMS2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
1700014D04RikJ3QMS2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700014D04RikJ3QMS2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700014D04RikJ3QMS2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700014D04RikJ3QMS2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700014D04RikJ3QMS2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700014D04RikJ3QMS2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700014D04RikJ3QMS2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700014D04RikJ3QMS2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
1700014D04RikJ3QMS2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700014D04RikJ3QMS2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700014D04RikJ3QMS2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700014D04RikJ3QMS2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700014D04RikJ3QMS2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700014D04RikJ3QMS2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700014D04RikJ3QMS2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700014D04RikJ3QMS2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700014D04RikJ3QMS2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700014D04RikJ3QMS2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700014D04RikJ3QMS2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
1700014D04RikJ3QMS2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700014D04RikJ3QMS2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700014D04RikJ3QMS2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700014D04RikJ3QMS2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700014D04RikJ3QMS2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700014D04RikJ3QMS2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700014D04RikJ3QMS2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700014D04RikJ3QMS2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700014D04RikJ3QMS2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700014D04RikJ3QMS2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700014D04RikJ3QMS2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700014D04RikJ3QMS2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700014D04RikJ3QMS2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700014D04RikJ3QMS2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700014D04RikJ3QMS2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700014D04RikJ3QMS2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700014D04RikJ3QMS2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700014D04RikJ3QMS2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700014D04RikJ3QMS2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700014D04RikJ3QMS2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700014D04RikJ3QMS2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700014D04RikJ3QMS2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700014D04RikJ3QMS2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700014D04RikJ3QMS2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700014D04RikJ3QMS2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700014D04RikJ3QMS2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700014D04RikJ3QMS2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700014D04RikJ3QMS2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700014D04RikJ3QMS2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700014D04RikJ3QMS2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700014D04RikJ3QMS2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700014D04RikJ3QMS2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700014D04RikJ3QMS2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700014D04RikJ3QMS2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700014D04RikJ3QMS2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700014D04RikJ3QMS2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700014D04RikJ3QMS2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
1700014D04RikJ3QMS2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700014D04RikJ3QMS2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700014D04RikJ3QMS2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700014D04RikJ3QMS2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
1700014D04RikJ3QMS2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700014D04RikJ3QMS2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700014D04RikJ3QMS2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700014D04RikJ3QMS2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700014D04RikJ3QMS2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700014D04RikJ3QMS2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700014D04RikJ3QMS2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700014D04RikJ3QMS2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
1700014D04RikJ3QMS2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700014D04RikJ3QMS2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700014D04RikJ3QMS2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700014D04RikJ3QMS2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
1700014D04RikJ3QMS2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700014D04RikJ3QMS2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24■■□□□ 1.43
1700014D04RikJ3QMS2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms