Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20830J3KML6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20830J3KML6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20830J3KML6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20830J3KML6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20830J3KML6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20830J3KML6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20830J3KML6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20830J3KML6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20830J3KML6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20830J3KML6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20830J3KML6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20830J3KML6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20830J3KML6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20830J3KML6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20830J3KML6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20830J3KML6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20830J3KML6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20830J3KML6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20830J3KML6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20830J3KML6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20830J3KML6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20830J3KML6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20830J3KML6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20830J3KML6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20830J3KML6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20830J3KML6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20830J3KML6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20830J3KML6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20830J3KML6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20830J3KML6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20830J3KML6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20830J3KML6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20830J3KML6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20830J3KML6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20830J3KML6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20830J3KML6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20830J3KML6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20830J3KML6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20830J3KML6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20830J3KML6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20830J3KML6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20830J3KML6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20830J3KML6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20830J3KML6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20830J3KML6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20830J3KML6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20830J3KML6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20830J3KML6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm20830J3KML6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm20830J3KML6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20830J3KML6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20830J3KML6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20830J3KML6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20830J3KML6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20830J3KML6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20830J3KML6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20830J3KML6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20830J3KML6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20830J3KML6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20830J3KML6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20830J3KML6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20830J3KML6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20830J3KML6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20830J3KML6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm20830J3KML6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20830J3KML6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20830J3KML6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20830J3KML6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20830J3KML6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20830J3KML6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20830J3KML6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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