Protein–RNA interactions for Protein: H3BLK7

Gm20695, Predicted gene 20695 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20695H3BLK7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20695H3BLK7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20695H3BLK7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20695H3BLK7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20695H3BLK7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20695H3BLK7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20695H3BLK7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20695H3BLK7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20695H3BLK7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20695H3BLK7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20695H3BLK7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20695H3BLK7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20695H3BLK7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20695H3BLK7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20695H3BLK7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20695H3BLK7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20695H3BLK7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20695H3BLK7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20695H3BLK7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20695H3BLK7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20695H3BLK7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20695H3BLK7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20695H3BLK7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20695H3BLK7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20695H3BLK7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20695H3BLK7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20695H3BLK7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20695H3BLK7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20695H3BLK7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20695H3BLK7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20695H3BLK7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20695H3BLK7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20695H3BLK7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20695H3BLK7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20695H3BLK7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20695H3BLK7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20695H3BLK7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20695H3BLK7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20695H3BLK7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm20695H3BLK7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20695H3BLK7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20695H3BLK7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20695H3BLK7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20695H3BLK7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20695H3BLK7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20695H3BLK7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20695H3BLK7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms