Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgxb3G3X9M3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgxb3G3X9M3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgxb3G3X9M3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgxb3G3X9M3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgxb3G3X9M3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgxb3G3X9M3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgxb3G3X9M3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgxb3G3X9M3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmgxb3G3X9M3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmgxb3G3X9M3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmgxb3G3X9M3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hmgxb3G3X9M3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgxb3G3X9M3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgxb3G3X9M3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgxb3G3X9M3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgxb3G3X9M3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgxb3G3X9M3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgxb3G3X9M3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgxb3G3X9M3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgxb3G3X9M3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgxb3G3X9M3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgxb3G3X9M3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hmgxb3G3X9M3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgxb3G3X9M3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgxb3G3X9M3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgxb3G3X9M3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmgxb3G3X9M3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmgxb3G3X9M3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmgxb3G3X9M3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmgxb3G3X9M3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmgxb3G3X9M3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmgxb3G3X9M3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmgxb3G3X9M3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmgxb3G3X9M3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmgxb3G3X9M3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmgxb3G3X9M3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmgxb3G3X9M3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmgxb3G3X9M3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgxb3G3X9M3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmgxb3G3X9M3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmgxb3G3X9M3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hmgxb3G3X9M3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmgxb3G3X9M3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmgxb3G3X9M3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmgxb3G3X9M3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmgxb3G3X9M3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmgxb3G3X9M3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hmgxb3G3X9M3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hmgxb3G3X9M3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmgxb3G3X9M3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmgxb3G3X9M3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmgxb3G3X9M3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmgxb3G3X9M3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmgxb3G3X9M3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgxb3G3X9M3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmgxb3G3X9M3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmgxb3G3X9M3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmgxb3G3X9M3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmgxb3G3X9M3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmgxb3G3X9M3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmgxb3G3X9M3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgxb3G3X9M3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgxb3G3X9M3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgxb3G3X9M3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmgxb3G3X9M3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmgxb3G3X9M3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmgxb3G3X9M3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmgxb3G3X9M3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmgxb3G3X9M3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hmgxb3G3X9M3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgxb3G3X9M3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmgxb3G3X9M3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmgxb3G3X9M3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgxb3G3X9M3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgxb3G3X9M3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgxb3G3X9M3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgxb3G3X9M3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgxb3G3X9M3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgxb3G3X9M3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmgxb3G3X9M3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgxb3G3X9M3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgxb3G3X9M3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgxb3G3X9M3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgxb3G3X9M3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgxb3G3X9M3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgxb3G3X9M3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgxb3G3X9M3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgxb3G3X9M3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgxb3G3X9M3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgxb3G3X9M3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgxb3G3X9M3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgxb3G3X9M3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgxb3G3X9M3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgxb3G3X9M3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgxb3G3X9M3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms