Protein–RNA interactions for Protein: G3X9B4

4933408B17Rik, MCG121508, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933408B17RikG3X9B4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933408B17RikG3X9B4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933408B17RikG3X9B4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933408B17RikG3X9B4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933408B17RikG3X9B4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933408B17RikG3X9B4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933408B17RikG3X9B4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933408B17RikG3X9B4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933408B17RikG3X9B4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933408B17RikG3X9B4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4933408B17RikG3X9B4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933408B17RikG3X9B4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933408B17RikG3X9B4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933408B17RikG3X9B4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
4933408B17RikG3X9B4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933408B17RikG3X9B4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933408B17RikG3X9B4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933408B17RikG3X9B4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933408B17RikG3X9B4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933408B17RikG3X9B4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933408B17RikG3X9B4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933408B17RikG3X9B4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4933408B17RikG3X9B4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933408B17RikG3X9B4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933408B17RikG3X9B4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933408B17RikG3X9B4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933408B17RikG3X9B4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933408B17RikG3X9B4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933408B17RikG3X9B4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933408B17RikG3X9B4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4933408B17RikG3X9B4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933408B17RikG3X9B4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933408B17RikG3X9B4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933408B17RikG3X9B4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933408B17RikG3X9B4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933408B17RikG3X9B4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933408B17RikG3X9B4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933408B17RikG3X9B4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933408B17RikG3X9B4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933408B17RikG3X9B4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933408B17RikG3X9B4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
4933408B17RikG3X9B4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933408B17RikG3X9B4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933408B17RikG3X9B4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933408B17RikG3X9B4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933408B17RikG3X9B4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933408B17RikG3X9B4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933408B17RikG3X9B4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933408B17RikG3X9B4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933408B17RikG3X9B4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933408B17RikG3X9B4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933408B17RikG3X9B4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933408B17RikG3X9B4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933408B17RikG3X9B4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933408B17RikG3X9B4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933408B17RikG3X9B4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933408B17RikG3X9B4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933408B17RikG3X9B4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933408B17RikG3X9B4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933408B17RikG3X9B4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933408B17RikG3X9B4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933408B17RikG3X9B4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933408B17RikG3X9B4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933408B17RikG3X9B4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933408B17RikG3X9B4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933408B17RikG3X9B4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933408B17RikG3X9B4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933408B17RikG3X9B4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933408B17RikG3X9B4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms