Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4cG3UXD1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Speer4cG3UXD1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4cG3UXD1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4cG3UXD1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4cG3UXD1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4cG3UXD1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4cG3UXD1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4cG3UXD1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4cG3UXD1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4cG3UXD1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4cG3UXD1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4cG3UXD1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4cG3UXD1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4cG3UXD1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4cG3UXD1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Speer4cG3UXD1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4cG3UXD1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4cG3UXD1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4cG3UXD1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4cG3UXD1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4cG3UXD1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4cG3UXD1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4cG3UXD1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4cG3UXD1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4cG3UXD1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4cG3UXD1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4cG3UXD1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4cG3UXD1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4cG3UXD1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4cG3UXD1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4cG3UXD1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4cG3UXD1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4cG3UXD1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4cG3UXD1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Speer4cG3UXD1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4cG3UXD1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4cG3UXD1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4cG3UXD1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4cG3UXD1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4cG3UXD1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4cG3UXD1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4cG3UXD1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4cG3UXD1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4cG3UXD1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4cG3UXD1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4cG3UXD1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4cG3UXD1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4cG3UXD1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Speer4cG3UXD1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4cG3UXD1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4cG3UXD1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4cG3UXD1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4cG3UXD1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4cG3UXD1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4cG3UXD1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4cG3UXD1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4cG3UXD1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4cG3UXD1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4cG3UXD1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4cG3UXD1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4cG3UXD1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4cG3UXD1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4cG3UXD1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4cG3UXD1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4cG3UXD1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4cG3UXD1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4cG3UXD1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4cG3UXD1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4cG3UXD1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4cG3UXD1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4cG3UXD1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4cG3UXD1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4cG3UXD1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4cG3UXD1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4cG3UXD1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4cG3UXD1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Speer4cG3UXD1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4cG3UXD1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4cG3UXD1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4cG3UXD1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4cG3UXD1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4cG3UXD1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4cG3UXD1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4cG3UXD1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4cG3UXD1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4cG3UXD1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms