Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20517G3UVU6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20517G3UVU6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20517G3UVU6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20517G3UVU6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20517G3UVU6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20517G3UVU6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20517G3UVU6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20517G3UVU6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20517G3UVU6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20517G3UVU6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20517G3UVU6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20517G3UVU6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20517G3UVU6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20517G3UVU6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20517G3UVU6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20517G3UVU6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20517G3UVU6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20517G3UVU6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20517G3UVU6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20517G3UVU6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20517G3UVU6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20517G3UVU6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20517G3UVU6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20517G3UVU6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20517G3UVU6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20517G3UVU6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20517G3UVU6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20517G3UVU6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20517G3UVU6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20517G3UVU6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20517G3UVU6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20517G3UVU6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20517G3UVU6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20517G3UVU6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20517G3UVU6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20517G3UVU6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20517G3UVU6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20517G3UVU6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20517G3UVU6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20517G3UVU6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20517G3UVU6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20517G3UVU6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20517G3UVU6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20517G3UVU6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20517G3UVU6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20517G3UVU6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20517G3UVU6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20517G3UVU6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20517G3UVU6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20517G3UVU6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20517G3UVU6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20517G3UVU6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20517G3UVU6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20517G3UVU6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20517G3UVU6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20517G3UVU6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20517G3UVU6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20517G3UVU6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20517G3UVU6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20517G3UVU6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms