Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ88

Gm5145, Predicted pseudogene 5145, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5145F8VQ88 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm5145F8VQ88 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm5145F8VQ88 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm5145F8VQ88 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5145F8VQ88 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5145F8VQ88 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5145F8VQ88 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5145F8VQ88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm5145F8VQ88 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm5145F8VQ88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm5145F8VQ88 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5145F8VQ88 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5145F8VQ88 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5145F8VQ88 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5145F8VQ88 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5145F8VQ88 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5145F8VQ88 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5145F8VQ88 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5145F8VQ88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5145F8VQ88 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5145F8VQ88 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5145F8VQ88 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5145F8VQ88 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5145F8VQ88 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5145F8VQ88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm5145F8VQ88 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm5145F8VQ88 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5145F8VQ88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5145F8VQ88 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5145F8VQ88 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5145F8VQ88 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5145F8VQ88 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5145F8VQ88 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5145F8VQ88 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5145F8VQ88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5145F8VQ88 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5145F8VQ88 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5145F8VQ88 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5145F8VQ88 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5145F8VQ88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5145F8VQ88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5145F8VQ88 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5145F8VQ88 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5145F8VQ88 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5145F8VQ88 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5145F8VQ88 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5145F8VQ88 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5145F8VQ88 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5145F8VQ88 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5145F8VQ88 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5145F8VQ88 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5145F8VQ88 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5145F8VQ88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5145F8VQ88 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5145F8VQ88 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5145F8VQ88 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5145F8VQ88 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5145F8VQ88 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5145F8VQ88 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5145F8VQ88 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5145F8VQ88 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5145F8VQ88 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5145F8VQ88 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5145F8VQ88 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5145F8VQ88 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5145F8VQ88 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5145F8VQ88 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5145F8VQ88 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5145F8VQ88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5145F8VQ88 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5145F8VQ88 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5145F8VQ88 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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