Protein–RNA interactions for Protein: F6R5P4

Ccl17, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl17F6R5P4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Ccl17F6R5P4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Ccl17F6R5P4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Ccl17F6R5P4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Ccl17F6R5P4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Ccl17F6R5P4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,18■□□□□ 0,66
Ccl17F6R5P4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Ccl17F6R5P4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Ccl17F6R5P4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Ccl17F6R5P4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,16■□□□□ 0,66
Ccl17F6R5P4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
Ccl17F6R5P4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
Ccl17F6R5P4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19,15■□□□□ 0,66
Ccl17F6R5P4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19,14■□□□□ 0,65
Ccl17F6R5P4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Ccl17F6R5P4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Ccl17F6R5P4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19,13■□□□□ 0,65
Ccl17F6R5P4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Ccl17F6R5P4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Ccl17F6R5P4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Ccl17F6R5P4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Ccl17F6R5P4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Ccl17F6R5P4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Ccl17F6R5P4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19,09■□□□□ 0,65
Ccl17F6R5P4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19,07■□□□□ 0,64
Ccl17F6R5P4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Ccl17F6R5P4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Ccl17F6R5P4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Ccl17F6R5P4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Ccl17F6R5P4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Ccl17F6R5P4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Ccl17F6R5P4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,04■□□□□ 0,64
Ccl17F6R5P4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Ccl17F6R5P4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19,04■□□□□ 0,64
Ccl17F6R5P4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Ccl17F6R5P4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Ccl17F6R5P4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Ccl17F6R5P4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Ccl17F6R5P4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Ccl17F6R5P4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Ccl17F6R5P4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Ccl17F6R5P4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18,92■□□□□ 0,62
Ccl17F6R5P4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,92■□□□□ 0,62
Ccl17F6R5P4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18,91■□□□□ 0,62
Ccl17F6R5P4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18,91■□□□□ 0,62
Ccl17F6R5P4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Ccl17F6R5P4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Ccl17F6R5P4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Ccl17F6R5P4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Ccl17F6R5P4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Ccl17F6R5P4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Ccl17F6R5P4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Ccl17F6R5P4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Ccl17F6R5P4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Ccl17F6R5P4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18,82■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,77■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,77■□□□□ 0,6
Ccl17F6R5P4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,75■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18,74■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18,73■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ccl17F6R5P4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Ccl17F6R5P4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,7■□□□□ 0,58
Ccl17F6R5P4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Ccl17F6R5P4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Ccl17F6R5P4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms