Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ccdc121E9Q6D3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ccdc121E9Q6D3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ccdc121E9Q6D3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ccdc121E9Q6D3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ccdc121E9Q6D3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ccdc121E9Q6D3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ccdc121E9Q6D3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Ccdc121E9Q6D3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ccdc121E9Q6D3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ccdc121E9Q6D3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ccdc121E9Q6D3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ccdc121E9Q6D3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ccdc121E9Q6D3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ccdc121E9Q6D3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ccdc121E9Q6D3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ccdc121E9Q6D3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ccdc121E9Q6D3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ccdc121E9Q6D3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ccdc121E9Q6D3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Ccdc121E9Q6D3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Ccdc121E9Q6D3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Ccdc121E9Q6D3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Ccdc121E9Q6D3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ccdc121E9Q6D3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ccdc121E9Q6D3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ccdc121E9Q6D3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Ccdc121E9Q6D3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Ccdc121E9Q6D3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ccdc121E9Q6D3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ccdc121E9Q6D3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ccdc121E9Q6D3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ccdc121E9Q6D3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ccdc121E9Q6D3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ccdc121E9Q6D3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ccdc121E9Q6D3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ccdc121E9Q6D3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Ccdc121E9Q6D3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Ccdc121E9Q6D3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ccdc121E9Q6D3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ccdc121E9Q6D3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ccdc121E9Q6D3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ccdc121E9Q6D3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ccdc121E9Q6D3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ccdc121E9Q6D3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ccdc121E9Q6D3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ccdc121E9Q6D3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ccdc121E9Q6D3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ccdc121E9Q6D3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ccdc121E9Q6D3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
Ccdc121E9Q6D3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ccdc121E9Q6D3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ccdc121E9Q6D3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ccdc121E9Q6D3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ccdc121E9Q6D3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,04
Ccdc121E9Q6D3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ccdc121E9Q6D3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ccdc121E9Q6D3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ccdc121E9Q6D3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Ccdc121E9Q6D3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Ccdc121E9Q6D3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ccdc121E9Q6D3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ccdc121E9Q6D3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Ccdc121E9Q6D3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ccdc121E9Q6D3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ccdc121E9Q6D3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ccdc121E9Q6D3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ccdc121E9Q6D3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ccdc121E9Q6D3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ccdc121E9Q6D3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ccdc121E9Q6D3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Ccdc121E9Q6D3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ccdc121E9Q6D3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ccdc121E9Q6D3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ccdc121E9Q6D3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ccdc121E9Q6D3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ccdc121E9Q6D3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Ccdc121E9Q6D3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Ccdc121E9Q6D3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Ccdc121E9Q6D3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Ccdc121E9Q6D3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ccdc121E9Q6D3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Ccdc121E9Q6D3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,53■■■□□ 2
Ccdc121E9Q6D3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ccdc121E9Q6D3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ccdc121E9Q6D3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ccdc121E9Q6D3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ccdc121E9Q6D3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ccdc121E9Q6D3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ccdc121E9Q6D3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ccdc121E9Q6D3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ccdc121E9Q6D3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ccdc121E9Q6D3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ccdc121E9Q6D3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Ccdc121E9Q6D3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Ccdc121E9Q6D3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ccdc121E9Q6D3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Ccdc121E9Q6D3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Ccdc121E9Q6D3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc121E9Q6D3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,8 ms