Protein–RNA interactions for Protein: E9Q422

A530032D15Rik, RIKEN cDNA A530032D15Rik gene, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530032D15RikE9Q422 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A530032D15RikE9Q422 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A530032D15RikE9Q422 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A530032D15RikE9Q422 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A530032D15RikE9Q422 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A530032D15RikE9Q422 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A530032D15RikE9Q422 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A530032D15RikE9Q422 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A530032D15RikE9Q422 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A530032D15RikE9Q422 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A530032D15RikE9Q422 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A530032D15RikE9Q422 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A530032D15RikE9Q422 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A530032D15RikE9Q422 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A530032D15RikE9Q422 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A530032D15RikE9Q422 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A530032D15RikE9Q422 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A530032D15RikE9Q422 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A530032D15RikE9Q422 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A530032D15RikE9Q422 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A530032D15RikE9Q422 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A530032D15RikE9Q422 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A530032D15RikE9Q422 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A530032D15RikE9Q422 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A530032D15RikE9Q422 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A530032D15RikE9Q422 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
A530032D15RikE9Q422 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A530032D15RikE9Q422 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A530032D15RikE9Q422 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
A530032D15RikE9Q422 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A530032D15RikE9Q422 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A530032D15RikE9Q422 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A530032D15RikE9Q422 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A530032D15RikE9Q422 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A530032D15RikE9Q422 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A530032D15RikE9Q422 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A530032D15RikE9Q422 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A530032D15RikE9Q422 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A530032D15RikE9Q422 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A530032D15RikE9Q422 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A530032D15RikE9Q422 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A530032D15RikE9Q422 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A530032D15RikE9Q422 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A530032D15RikE9Q422 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A530032D15RikE9Q422 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A530032D15RikE9Q422 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A530032D15RikE9Q422 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A530032D15RikE9Q422 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A530032D15RikE9Q422 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
A530032D15RikE9Q422 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A530032D15RikE9Q422 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A530032D15RikE9Q422 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A530032D15RikE9Q422 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A530032D15RikE9Q422 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A530032D15RikE9Q422 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A530032D15RikE9Q422 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A530032D15RikE9Q422 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A530032D15RikE9Q422 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A530032D15RikE9Q422 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A530032D15RikE9Q422 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A530032D15RikE9Q422 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A530032D15RikE9Q422 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A530032D15RikE9Q422 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
A530032D15RikE9Q422 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A530032D15RikE9Q422 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A530032D15RikE9Q422 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A530032D15RikE9Q422 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
A530032D15RikE9Q422 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A530032D15RikE9Q422 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A530032D15RikE9Q422 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A530032D15RikE9Q422 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A530032D15RikE9Q422 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A530032D15RikE9Q422 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A530032D15RikE9Q422 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A530032D15RikE9Q422 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A530032D15RikE9Q422 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A530032D15RikE9Q422 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A530032D15RikE9Q422 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A530032D15RikE9Q422 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A530032D15RikE9Q422 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A530032D15RikE9Q422 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A530032D15RikE9Q422 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A530032D15RikE9Q422 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A530032D15RikE9Q422 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A530032D15RikE9Q422 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A530032D15RikE9Q422 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A530032D15RikE9Q422 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms