Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Y9

Krt83, Keratin 83, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt83E9Q1Y9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt83E9Q1Y9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt83E9Q1Y9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt83E9Q1Y9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt83E9Q1Y9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt83E9Q1Y9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt83E9Q1Y9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt83E9Q1Y9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt83E9Q1Y9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt83E9Q1Y9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt83E9Q1Y9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt83E9Q1Y9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt83E9Q1Y9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt83E9Q1Y9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt83E9Q1Y9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt83E9Q1Y9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt83E9Q1Y9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt83E9Q1Y9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt83E9Q1Y9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt83E9Q1Y9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt83E9Q1Y9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt83E9Q1Y9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt83E9Q1Y9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt83E9Q1Y9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt83E9Q1Y9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt83E9Q1Y9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt83E9Q1Y9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt83E9Q1Y9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt83E9Q1Y9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt83E9Q1Y9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt83E9Q1Y9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt83E9Q1Y9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt83E9Q1Y9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt83E9Q1Y9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt83E9Q1Y9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt83E9Q1Y9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt83E9Q1Y9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt83E9Q1Y9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt83E9Q1Y9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt83E9Q1Y9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt83E9Q1Y9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt83E9Q1Y9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt83E9Q1Y9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt83E9Q1Y9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt83E9Q1Y9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt83E9Q1Y9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt83E9Q1Y9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt83E9Q1Y9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt83E9Q1Y9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt83E9Q1Y9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt83E9Q1Y9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt83E9Q1Y9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt83E9Q1Y9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt83E9Q1Y9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt83E9Q1Y9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt83E9Q1Y9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt83E9Q1Y9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Krt83E9Q1Y9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt83E9Q1Y9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt83E9Q1Y9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt83E9Q1Y9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt83E9Q1Y9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt83E9Q1Y9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt83E9Q1Y9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt83E9Q1Y9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt83E9Q1Y9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt83E9Q1Y9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt83E9Q1Y9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt83E9Q1Y9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt83E9Q1Y9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt83E9Q1Y9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt83E9Q1Y9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt83E9Q1Y9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt83E9Q1Y9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt83E9Q1Y9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms