Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1500009C09RikD3YYW9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1500009C09RikD3YYW9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1500009C09RikD3YYW9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1500009C09RikD3YYW9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1500009C09RikD3YYW9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1500009C09RikD3YYW9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1500009C09RikD3YYW9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1500009C09RikD3YYW9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1500009C09RikD3YYW9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1500009C09RikD3YYW9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
1500009C09RikD3YYW9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
1500009C09RikD3YYW9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1500009C09RikD3YYW9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1500009C09RikD3YYW9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
1500009C09RikD3YYW9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1500009C09RikD3YYW9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1500009C09RikD3YYW9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1500009C09RikD3YYW9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1500009C09RikD3YYW9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1500009C09RikD3YYW9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1500009C09RikD3YYW9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1500009C09RikD3YYW9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1500009C09RikD3YYW9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1500009C09RikD3YYW9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1500009C09RikD3YYW9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1500009C09RikD3YYW9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1500009C09RikD3YYW9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1500009C09RikD3YYW9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1500009C09RikD3YYW9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1500009C09RikD3YYW9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1500009C09RikD3YYW9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1500009C09RikD3YYW9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1500009C09RikD3YYW9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1500009C09RikD3YYW9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1500009C09RikD3YYW9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1500009C09RikD3YYW9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1500009C09RikD3YYW9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1500009C09RikD3YYW9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1500009C09RikD3YYW9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1500009C09RikD3YYW9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1500009C09RikD3YYW9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1500009C09RikD3YYW9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1500009C09RikD3YYW9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1500009C09RikD3YYW9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1500009C09RikD3YYW9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1500009C09RikD3YYW9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1500009C09RikD3YYW9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1500009C09RikD3YYW9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1500009C09RikD3YYW9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1500009C09RikD3YYW9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1500009C09RikD3YYW9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1500009C09RikD3YYW9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1500009C09RikD3YYW9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1500009C09RikD3YYW9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1500009C09RikD3YYW9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1500009C09RikD3YYW9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1500009C09RikD3YYW9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1500009C09RikD3YYW9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1500009C09RikD3YYW9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1500009C09RikD3YYW9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1500009C09RikD3YYW9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1500009C09RikD3YYW9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1500009C09RikD3YYW9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1500009C09RikD3YYW9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1500009C09RikD3YYW9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1500009C09RikD3YYW9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1500009C09RikD3YYW9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
1500009C09RikD3YYW9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1500009C09RikD3YYW9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1500009C09RikD3YYW9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
1500009C09RikD3YYW9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1500009C09RikD3YYW9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
1500009C09RikD3YYW9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms