Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kpna7C0LLJ0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kpna7C0LLJ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kpna7C0LLJ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kpna7C0LLJ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kpna7C0LLJ0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kpna7C0LLJ0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kpna7C0LLJ0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kpna7C0LLJ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kpna7C0LLJ0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kpna7C0LLJ0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kpna7C0LLJ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kpna7C0LLJ0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kpna7C0LLJ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kpna7C0LLJ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kpna7C0LLJ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kpna7C0LLJ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Kpna7C0LLJ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kpna7C0LLJ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kpna7C0LLJ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kpna7C0LLJ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kpna7C0LLJ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kpna7C0LLJ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kpna7C0LLJ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kpna7C0LLJ0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kpna7C0LLJ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kpna7C0LLJ0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kpna7C0LLJ0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kpna7C0LLJ0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kpna7C0LLJ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kpna7C0LLJ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kpna7C0LLJ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kpna7C0LLJ0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kpna7C0LLJ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kpna7C0LLJ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Kpna7C0LLJ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kpna7C0LLJ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kpna7C0LLJ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kpna7C0LLJ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Kpna7C0LLJ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kpna7C0LLJ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kpna7C0LLJ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kpna7C0LLJ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kpna7C0LLJ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kpna7C0LLJ0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kpna7C0LLJ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kpna7C0LLJ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kpna7C0LLJ0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kpna7C0LLJ0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kpna7C0LLJ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kpna7C0LLJ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kpna7C0LLJ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kpna7C0LLJ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kpna7C0LLJ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kpna7C0LLJ0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kpna7C0LLJ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kpna7C0LLJ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kpna7C0LLJ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna7C0LLJ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna7C0LLJ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Kpna7C0LLJ0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kpna7C0LLJ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kpna7C0LLJ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kpna7C0LLJ0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kpna7C0LLJ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kpna7C0LLJ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kpna7C0LLJ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kpna7C0LLJ0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kpna7C0LLJ0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kpna7C0LLJ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kpna7C0LLJ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kpna7C0LLJ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kpna7C0LLJ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Kpna7C0LLJ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kpna7C0LLJ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kpna7C0LLJ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kpna7C0LLJ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kpna7C0LLJ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kpna7C0LLJ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kpna7C0LLJ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kpna7C0LLJ0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kpna7C0LLJ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kpna7C0LLJ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kpna7C0LLJ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms