Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apba1B2RUJ5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apba1B2RUJ5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apba1B2RUJ5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apba1B2RUJ5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apba1B2RUJ5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apba1B2RUJ5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apba1B2RUJ5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apba1B2RUJ5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Apba1B2RUJ5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apba1B2RUJ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apba1B2RUJ5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apba1B2RUJ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Apba1B2RUJ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Apba1B2RUJ5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Apba1B2RUJ5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apba1B2RUJ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apba1B2RUJ5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apba1B2RUJ5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apba1B2RUJ5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apba1B2RUJ5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Apba1B2RUJ5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apba1B2RUJ5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apba1B2RUJ5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Apba1B2RUJ5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apba1B2RUJ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apba1B2RUJ5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apba1B2RUJ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apba1B2RUJ5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apba1B2RUJ5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apba1B2RUJ5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Apba1B2RUJ5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apba1B2RUJ5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apba1B2RUJ5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apba1B2RUJ5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apba1B2RUJ5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apba1B2RUJ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apba1B2RUJ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apba1B2RUJ5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Apba1B2RUJ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apba1B2RUJ5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apba1B2RUJ5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apba1B2RUJ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apba1B2RUJ5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apba1B2RUJ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apba1B2RUJ5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apba1B2RUJ5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apba1B2RUJ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apba1B2RUJ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apba1B2RUJ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apba1B2RUJ5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apba1B2RUJ5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apba1B2RUJ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apba1B2RUJ5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apba1B2RUJ5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apba1B2RUJ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apba1B2RUJ5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apba1B2RUJ5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apba1B2RUJ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apba1B2RUJ5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apba1B2RUJ5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apba1B2RUJ5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apba1B2RUJ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apba1B2RUJ5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apba1B2RUJ5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apba1B2RUJ5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apba1B2RUJ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apba1B2RUJ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apba1B2RUJ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apba1B2RUJ5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apba1B2RUJ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apba1B2RUJ5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apba1B2RUJ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apba1B2RUJ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apba1B2RUJ5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apba1B2RUJ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apba1B2RUJ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apba1B2RUJ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apba1B2RUJ5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apba1B2RUJ5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apba1B2RUJ5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Apba1B2RUJ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apba1B2RUJ5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apba1B2RUJ5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apba1B2RUJ5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apba1B2RUJ5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apba1B2RUJ5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apba1B2RUJ5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Apba1B2RUJ5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apba1B2RUJ5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Apba1B2RUJ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apba1B2RUJ5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Apba1B2RUJ5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apba1B2RUJ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apba1B2RUJ5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Apba1B2RUJ5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apba1B2RUJ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apba1B2RUJ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apba1B2RUJ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Apba1B2RUJ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms