Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD6

Slfn9, Schlafen 9, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn9B1ARD6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn9B1ARD6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn9B1ARD6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slfn9B1ARD6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slfn9B1ARD6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slfn9B1ARD6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slfn9B1ARD6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Slfn9B1ARD6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slfn9B1ARD6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Slfn9B1ARD6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn9B1ARD6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn9B1ARD6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn9B1ARD6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn9B1ARD6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn9B1ARD6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn9B1ARD6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn9B1ARD6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slfn9B1ARD6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slfn9B1ARD6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slfn9B1ARD6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slfn9B1ARD6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn9B1ARD6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn9B1ARD6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slfn9B1ARD6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slfn9B1ARD6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Slfn9B1ARD6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slfn9B1ARD6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slfn9B1ARD6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slfn9B1ARD6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn9B1ARD6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn9B1ARD6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slfn9B1ARD6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfn9B1ARD6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfn9B1ARD6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfn9B1ARD6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfn9B1ARD6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfn9B1ARD6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfn9B1ARD6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfn9B1ARD6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn9B1ARD6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn9B1ARD6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfn9B1ARD6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfn9B1ARD6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfn9B1ARD6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfn9B1ARD6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfn9B1ARD6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfn9B1ARD6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfn9B1ARD6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfn9B1ARD6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn9B1ARD6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn9B1ARD6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn9B1ARD6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slfn9B1ARD6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slfn9B1ARD6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn9B1ARD6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slfn9B1ARD6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Slfn9B1ARD6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slfn9B1ARD6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slfn9B1ARD6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slfn9B1ARD6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn9B1ARD6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn9B1ARD6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn9B1ARD6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn9B1ARD6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn9B1ARD6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn9B1ARD6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slfn9B1ARD6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slfn9B1ARD6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slfn9B1ARD6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slfn9B1ARD6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slfn9B1ARD6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slfn9B1ARD6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn9B1ARD6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn9B1ARD6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Slfn9B1ARD6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slfn9B1ARD6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slfn9B1ARD6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slfn9B1ARD6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slfn9B1ARD6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slfn9B1ARD6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slfn9B1ARD6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slfn9B1ARD6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slfn9B1ARD6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Slfn9B1ARD6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slfn9B1ARD6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slfn9B1ARD6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slfn9B1ARD6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slfn9B1ARD6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slfn9B1ARD6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slfn9B1ARD6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slfn9B1ARD6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slfn9B1ARD6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slfn9B1ARD6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slfn9B1ARD6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn9B1ARD6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn9B1ARD6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn9B1ARD6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn9B1ARD6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn9B1ARD6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn9B1ARD6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms