Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm3173A6NAS3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm3173A6NAS3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm3173A6NAS3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm3173A6NAS3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm3173A6NAS3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm3173A6NAS3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm3173A6NAS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gm3173A6NAS3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm3173A6NAS3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm3173A6NAS3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm3173A6NAS3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm3173A6NAS3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm3173A6NAS3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm3173A6NAS3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm3173A6NAS3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3173A6NAS3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3173A6NAS3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3173A6NAS3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3173A6NAS3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3173A6NAS3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3173A6NAS3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm3173A6NAS3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm3173A6NAS3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm3173A6NAS3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm3173A6NAS3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm3173A6NAS3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3173A6NAS3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm3173A6NAS3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm3173A6NAS3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm3173A6NAS3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm3173A6NAS3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3173A6NAS3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3173A6NAS3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3173A6NAS3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm3173A6NAS3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm3173A6NAS3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm3173A6NAS3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm3173A6NAS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm3173A6NAS3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm3173A6NAS3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm3173A6NAS3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm3173A6NAS3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3173A6NAS3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm3173A6NAS3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm3173A6NAS3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm3173A6NAS3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm3173A6NAS3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm3173A6NAS3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm3173A6NAS3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm3173A6NAS3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3173A6NAS3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3173A6NAS3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm3173A6NAS3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3173A6NAS3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3173A6NAS3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3173A6NAS3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3173A6NAS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3173A6NAS3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3173A6NAS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3173A6NAS3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3173A6NAS3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3173A6NAS3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3173A6NAS3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3173A6NAS3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3173A6NAS3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3173A6NAS3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3173A6NAS3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3173A6NAS3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3173A6NAS3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3173A6NAS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3173A6NAS3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3173A6NAS3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3173A6NAS3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm3173A6NAS3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3173A6NAS3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3173A6NAS3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3173A6NAS3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3173A6NAS3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3173A6NAS3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3173A6NAS3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3173A6NAS3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3173A6NAS3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3173A6NAS3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3173A6NAS3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3173A6NAS3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm3173A6NAS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm3173A6NAS3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm3173A6NAS3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm3173A6NAS3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3173A6NAS3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3173A6NAS3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3173A6NAS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3173A6NAS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3173A6NAS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm3173A6NAS3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm3173A6NAS3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm3173A6NAS3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm3173A6NAS3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3173A6NAS3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms