Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Gm3173A6NAS3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Gm3173A6NAS3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Gm3173A6NAS3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Gm3173A6NAS3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Gm3173A6NAS3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26,35■■□□□ 1,81
Gm3173A6NAS3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Gm3173A6NAS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,8
Gm3173A6NAS3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Gm3173A6NAS3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Gm3173A6NAS3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Gm3173A6NAS3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Gm3173A6NAS3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Gm3173A6NAS3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Gm3173A6NAS3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26,28■■□□□ 1,8
Gm3173A6NAS3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Gm3173A6NAS3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Gm3173A6NAS3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Gm3173A6NAS3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,24■■□□□ 1,79
Gm3173A6NAS3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Gm3173A6NAS3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Gm3173A6NAS3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Gm3173A6NAS3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
Gm3173A6NAS3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Gm3173A6NAS3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Gm3173A6NAS3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Gm3173A6NAS3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Gm3173A6NAS3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,14■■□□□ 1,77
Gm3173A6NAS3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Gm3173A6NAS3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Gm3173A6NAS3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Gm3173A6NAS3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gm3173A6NAS3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gm3173A6NAS3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gm3173A6NAS3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Gm3173A6NAS3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Gm3173A6NAS3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Gm3173A6NAS3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Gm3173A6NAS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Gm3173A6NAS3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Gm3173A6NAS3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Gm3173A6NAS3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1,75
Gm3173A6NAS3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Gm3173A6NAS3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Gm3173A6NAS3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Gm3173A6NAS3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Gm3173A6NAS3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Gm3173A6NAS3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Gm3173A6NAS3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Gm3173A6NAS3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Gm3173A6NAS3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Gm3173A6NAS3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
Gm3173A6NAS3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Gm3173A6NAS3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gm3173A6NAS3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gm3173A6NAS3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gm3173A6NAS3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gm3173A6NAS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gm3173A6NAS3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Gm3173A6NAS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Gm3173A6NAS3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Gm3173A6NAS3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Gm3173A6NAS3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Gm3173A6NAS3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Gm3173A6NAS3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gm3173A6NAS3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gm3173A6NAS3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gm3173A6NAS3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
Gm3173A6NAS3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Gm3173A6NAS3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Gm3173A6NAS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Gm3173A6NAS3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Gm3173A6NAS3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Gm3173A6NAS3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gm3173A6NAS3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gm3173A6NAS3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gm3173A6NAS3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Gm3173A6NAS3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gm3173A6NAS3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gm3173A6NAS3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gm3173A6NAS3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gm3173A6NAS3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gm3173A6NAS3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gm3173A6NAS3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Gm3173A6NAS3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gm3173A6NAS3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gm3173A6NAS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gm3173A6NAS3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gm3173A6NAS3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gm3173A6NAS3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gm3173A6NAS3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Gm3173A6NAS3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gm3173A6NAS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gm3173A6NAS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gm3173A6NAS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gm3173A6NAS3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gm3173A6NAS3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gm3173A6NAS3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gm3173A6NAS3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gm3173A6NAS3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,3 ms