Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Htra4A2RT60 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Htra4A2RT60 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Htra4A2RT60 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htra4A2RT60 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htra4A2RT60 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htra4A2RT60 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htra4A2RT60 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htra4A2RT60 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htra4A2RT60 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htra4A2RT60 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htra4A2RT60 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Htra4A2RT60 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htra4A2RT60 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htra4A2RT60 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htra4A2RT60 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htra4A2RT60 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htra4A2RT60 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htra4A2RT60 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htra4A2RT60 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htra4A2RT60 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htra4A2RT60 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htra4A2RT60 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htra4A2RT60 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htra4A2RT60 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htra4A2RT60 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Htra4A2RT60 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Htra4A2RT60 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Htra4A2RT60 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Htra4A2RT60 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Htra4A2RT60 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htra4A2RT60 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Htra4A2RT60 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htra4A2RT60 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htra4A2RT60 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htra4A2RT60 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htra4A2RT60 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htra4A2RT60 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htra4A2RT60 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Htra4A2RT60 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htra4A2RT60 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htra4A2RT60 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htra4A2RT60 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htra4A2RT60 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htra4A2RT60 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htra4A2RT60 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htra4A2RT60 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htra4A2RT60 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htra4A2RT60 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htra4A2RT60 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htra4A2RT60 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htra4A2RT60 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htra4A2RT60 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Htra4A2RT60 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Htra4A2RT60 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htra4A2RT60 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htra4A2RT60 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htra4A2RT60 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htra4A2RT60 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Htra4A2RT60 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htra4A2RT60 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htra4A2RT60 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htra4A2RT60 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htra4A2RT60 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htra4A2RT60 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htra4A2RT60 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htra4A2RT60 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htra4A2RT60 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htra4A2RT60 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htra4A2RT60 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htra4A2RT60 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htra4A2RT60 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Htra4A2RT60 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htra4A2RT60 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htra4A2RT60 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htra4A2RT60 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htra4A2RT60 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htra4A2RT60 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htra4A2RT60 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Htra4A2RT60 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htra4A2RT60 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htra4A2RT60 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htra4A2RT60 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htra4A2RT60 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htra4A2RT60 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htra4A2RT60 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htra4A2RT60 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms