Protein–RNA interactions for Protein: A2AR95

Ldlrad3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad3A2AR95 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldlrad3A2AR95 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ldlrad3A2AR95 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldlrad3A2AR95 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldlrad3A2AR95 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldlrad3A2AR95 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldlrad3A2AR95 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldlrad3A2AR95 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldlrad3A2AR95 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ldlrad3A2AR95 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ldlrad3A2AR95 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ldlrad3A2AR95 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ldlrad3A2AR95 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldlrad3A2AR95 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldlrad3A2AR95 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ldlrad3A2AR95 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ldlrad3A2AR95 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ldlrad3A2AR95 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ldlrad3A2AR95 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ldlrad3A2AR95 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ldlrad3A2AR95 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ldlrad3A2AR95 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ldlrad3A2AR95 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldlrad3A2AR95 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldlrad3A2AR95 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ldlrad3A2AR95 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ldlrad3A2AR95 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ldlrad3A2AR95 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ldlrad3A2AR95 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ldlrad3A2AR95 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ldlrad3A2AR95 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldlrad3A2AR95 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldlrad3A2AR95 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldlrad3A2AR95 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldlrad3A2AR95 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ldlrad3A2AR95 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ldlrad3A2AR95 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ldlrad3A2AR95 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ldlrad3A2AR95 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ldlrad3A2AR95 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ldlrad3A2AR95 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ldlrad3A2AR95 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ldlrad3A2AR95 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ldlrad3A2AR95 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ldlrad3A2AR95 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ldlrad3A2AR95 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ldlrad3A2AR95 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldlrad3A2AR95 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ldlrad3A2AR95 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ldlrad3A2AR95 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ldlrad3A2AR95 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ldlrad3A2AR95 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ldlrad3A2AR95 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ldlrad3A2AR95 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ldlrad3A2AR95 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ldlrad3A2AR95 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ldlrad3A2AR95 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldlrad3A2AR95 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldlrad3A2AR95 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldlrad3A2AR95 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldlrad3A2AR95 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ldlrad3A2AR95 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ldlrad3A2AR95 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ldlrad3A2AR95 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ldlrad3A2AR95 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ldlrad3A2AR95 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldlrad3A2AR95 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldlrad3A2AR95 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldlrad3A2AR95 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ldlrad3A2AR95 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ldlrad3A2AR95 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ldlrad3A2AR95 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldlrad3A2AR95 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ldlrad3A2AR95 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ldlrad3A2AR95 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad3A2AR95 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ldlrad3A2AR95 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ldlrad3A2AR95 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ldlrad3A2AR95 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldlrad3A2AR95 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldlrad3A2AR95 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldlrad3A2AR95 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldlrad3A2AR95 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldlrad3A2AR95 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldlrad3A2AR95 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad3A2AR95 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldlrad3A2AR95 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldlrad3A2AR95 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldlrad3A2AR95 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldlrad3A2AR95 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldlrad3A2AR95 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldlrad3A2AR95 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldlrad3A2AR95 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldlrad3A2AR95 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldlrad3A2AR95 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldlrad3A2AR95 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldlrad3A2AR95 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldlrad3A2AR95 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldlrad3A2AR95 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldlrad3A2AR95 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms