Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34dA2AGU5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34dA2AGU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn34dA2AGU5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn34dA2AGU5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn34dA2AGU5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn34dA2AGU5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cldn34dA2AGU5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn34dA2AGU5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn34dA2AGU5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn34dA2AGU5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn34dA2AGU5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn34dA2AGU5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn34dA2AGU5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn34dA2AGU5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34dA2AGU5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34dA2AGU5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34dA2AGU5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34dA2AGU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34dA2AGU5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34dA2AGU5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34dA2AGU5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34dA2AGU5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34dA2AGU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34dA2AGU5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34dA2AGU5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn34dA2AGU5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn34dA2AGU5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34dA2AGU5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34dA2AGU5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34dA2AGU5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn34dA2AGU5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn34dA2AGU5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn34dA2AGU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn34dA2AGU5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn34dA2AGU5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34dA2AGU5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34dA2AGU5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn34dA2AGU5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34dA2AGU5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34dA2AGU5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34dA2AGU5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn34dA2AGU5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn34dA2AGU5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn34dA2AGU5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn34dA2AGU5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn34dA2AGU5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn34dA2AGU5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn34dA2AGU5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn34dA2AGU5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn34dA2AGU5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn34dA2AGU5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn34dA2AGU5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn34dA2AGU5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn34dA2AGU5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn34dA2AGU5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn34dA2AGU5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn34dA2AGU5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn34dA2AGU5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn34dA2AGU5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms