Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms