Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRE8

Zscan4e, Zinc finger and SCAN domain-containing 4E, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zscan4eA0A1B0GRE8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zscan4eA0A1B0GRE8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zscan4eA0A1B0GRE8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zscan4eA0A1B0GRE8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zscan4eA0A1B0GRE8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zscan4eA0A1B0GRE8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zscan4eA0A1B0GRE8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zscan4eA0A1B0GRE8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zscan4eA0A1B0GRE8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan4eA0A1B0GRE8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Zscan4eA0A1B0GRE8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zscan4eA0A1B0GRE8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zscan4eA0A1B0GRE8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zscan4eA0A1B0GRE8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zscan4eA0A1B0GRE8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms