Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRE8

Zscan4e, Zinc finger and SCAN domain-containing 4E, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zscan4eA0A1B0GRE8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zscan4eA0A1B0GRE8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zscan4eA0A1B0GRE8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zscan4eA0A1B0GRE8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zscan4eA0A1B0GRE8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zscan4eA0A1B0GRE8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zscan4eA0A1B0GRE8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zscan4eA0A1B0GRE8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zscan4eA0A1B0GRE8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zscan4eA0A1B0GRE8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zscan4eA0A1B0GRE8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan4eA0A1B0GRE8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan4eA0A1B0GRE8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Zscan4eA0A1B0GRE8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zscan4eA0A1B0GRE8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zscan4eA0A1B0GRE8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zscan4eA0A1B0GRE8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zscan4eA0A1B0GRE8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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