Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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