Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP3Q8WYN3 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms