Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms