Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNA2P51530 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNA2P51530 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms