Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGCXP38435 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGCXP38435 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GGCXP38435 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GGCXP38435 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GGCXP38435 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GGCXP38435 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms