Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms