Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms