Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERPINC1P01008 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms