Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 PIN1P1-202ENST00000439639 301 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 FXYD3-207ENST00000604255 780 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 AC130469.2-201ENST00000625112 1092 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NESP48681 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NESP48681 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NESP48681 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NESP48681 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 AL359094.2-201ENST00000420941 750 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 MTND6P9-201ENST00000458075 519 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 RBP5-202ENST00000542370 564 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 SARS2-211ENST00000598831 665 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 NPL-205ENST00000367555 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NESP48681 C1orf158-201ENST00000376210 695 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 GAPDHP76-201ENST00000512278 976 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 AL353997.3-201ENST00000586597 589 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 AC010615.2-201ENST00000596705 566 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NESP48681 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms