Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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