Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 FAM46A-202ENST00000369754 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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