Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TMEM225BP0DP42 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms