Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms