Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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