Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms