Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms