Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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