Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms