Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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RNF182Q8N6D2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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RNF182Q8N6D2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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RNF182Q8N6D2 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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RNF182Q8N6D2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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RNF182Q8N6D2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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RNF182Q8N6D2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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RNF182Q8N6D2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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