Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms