Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC011456.1-201ENST00000592270 536 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC025165.4-201ENST00000602327 433 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC131097.4-201ENST00000442867 571 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 NDFIP2-AS1-201ENST00000457171 431 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ENTPD1-AS1-210ENST00000452942 864 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AL512631.1-201ENST00000604086 840 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 RTP2-201ENST00000358241 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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