Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTSSP25774 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTSSP25774 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTSSP25774 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTSSP25774 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CTSSP25774 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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CTSSP25774 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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CTSSP25774 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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CTSSP25774 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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CTSSP25774 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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CTSSP25774 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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CTSSP25774 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTSSP25774 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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CTSSP25774 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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CTSSP25774 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTSSP25774 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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CTSSP25774 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CTSSP25774 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CTSSP25774 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CTSSP25774 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CTSSP25774 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CTSSP25774 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CTSSP25774 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTSSP25774 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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